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[发明专利]确定多位点PEG修饰蛋白质修饰位点的分析方法-CN201910409771.9有效
发明人：胡春兰;陈清;付志成;栾秋洋;范开 -专利权人：重庆派金生物科技有限公司
申请日： 2019-05-17 - 公布日： 2021-08-10 - 主分类号： G01N30/88 文献下载
摘要：本发明公开的一种多位点修饰修饰位点分析技术，实现了对4个及以上修饰位点的PEG化蛋白修饰位点定位，避免了对无法测准分子量的PEG修饰肽段的直接测定，而选择对PEG修饰肽段特异性回收并再次酶切后对不含被修饰位点的肽段进行精准的分子量测定，与理论肽段对比后得出准确的PEG修饰位点。本方法实现了对平均修饰度较高高的修饰位点较多的蛋白的修饰位点测定，对PEG修饰肽段具有特异性，简化检测步骤，减少工作量，操作方便，易于实施，重现率高。
确定多位点 peg 修饰蛋白质分析方法

[发明专利]基于最近邻算法的蛋白激酶特异性预测方法及装置-CN201310676124.7在审
发明人：周丰丰;赵苗苗;张召;罗幼喜;麦国琴 -专利权人：深圳先进技术研究院
申请日： 2013-12-11 - 公布日： 2014-04-23 - 主分类号： G06F19/18 文献下载
摘要：本发明涉及蛋白质修饰化位点识别技术领域，具体涉及一种基于最近邻算法的蛋白激酶特异性预测方法及装置。本发明的预测方法充分利用了磷酸化位点上游、下游的氨基酸信息，增加了预测的正确率；本发明的预测方法利用氨基酸置换矩阵对待测磷酸化位点肽段和已知磷酸化位点肽段的相似性打分，将待测磷酸化位点肽段标注为得分最高的已知磷酸化位点肽段
基于近邻算法蛋白激酶特异性预测方法装置

[发明专利]一种糖肽表位预测方法、存储介质及终端设备-CN202111080403.8在审
发明人：毛家维;王鹏 -专利权人：南方科技大学
申请日： 2021-09-15 - 公布日： 2021-12-28 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种糖肽表位预测方法、存储介质及终端设备，其中，方法包括步骤：基于天然主要组织相容性复合体数据，构建抗原呈递概率预测模型；从糖肽数据库中收集肽段糖基化位点信息及其对应的肽段序列，构建糖基化位点数据集；基于所述糖基化位点数据集，构建糖基化位点预测模型；将待预测肽段序列输入所述抗原呈递概率预测模型，预测所述待预测肽段序列的抗原呈递分数；将抗原呈递分数大于阈值的待预测肽段序列输入所述糖基化位点预测模型，预测所述待预测肽段序列的糖基化位点。通过本发明方法能够直接预测糖肽的免疫原性，在提高肽段筛选效率的同时，能够更准确地预测具有免疫原性的糖肽，为疫苗设计、自身免疫以及癌症的研究提供重要工具。
一种糖肽预测方法存储介质终端设备

[发明专利]一种基于阴离子交换色谱柱的SUMO化肽段的富集方法-CN201811390002.0有效
发明人：张丽华;李洋;孙明伟;单亦初;杨开广;张玉奎 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2018-11-21 - 公布日： 2022-05-17 - 主分类号： G01N30/08 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于阴离子交换色谱柱的SUMO化肽段的富集方法，包括：蛋白质碱性位点酶切、在碱性环境中通过阴离子交换色谱柱去除保留弱的酶解肽段、收集保留较强的SUMO化肽段流出液。首先对蛋白的碱性位点进行酶切，酶切后的SUMO化肽段有多个酸性氨基酸，在碱性环境中其在阴离子交换色谱柱中的保留较非SUMO化肽段更强，采用阴离子交换色谱柱先对保留较弱的酶切产物进行洗脱，最后收集保留较强的肽段组分，即为富集后的SUMO化肽段。本发明的优点是操作步骤简单方便、选择性高、富集效率高、可同时富集多类型的SUMO化肽段、提高了SUMO化修饰位点的鉴定覆盖度。
一种基于阴离子交换色谱 sumo 化肽段富集方法

[发明专利]不需诱导的二拆分Dre重组酶系统-CN202310041209.1在审
发明人：谢池楚;齐广莹;刘瑜;余文涛;甘进锋 -专利权人：桂林医学院
申请日： 2023-01-12 - 公布日： 2023-09-12 - 主分类号： C12N9/12 文献下载
摘要：本发明公开了不需诱导的二拆分Dre重组酶系统，属于生物技术领域，不需诱导的二拆分Dre重组酶，包括以下形成步骤：Dre蛋白的二拆分设计，293T细胞中筛选不需诱导就具重组酶活性的二拆分Dre蛋白组合，二拆分Dre蛋白能在rox位点稳转293T细胞、小鼠细胞系和E.coli中有效介导位点特异性重组。可以实现通过Dre60和61位点氨基酸之间拆分的两Dre肽段能通过内含肽Intein辅助，构成能介导rox位点间序列重组的重组酶；而Dre191和192位点氨基酸之间拆分的两Dre肽段在不需要任何其他融合蛋白的辅助下就能有效互补，介导rox位点间序列的重组，并且此两Dre肽段与拆分的Cre肽段之间不能相互互补，能保证在同时拆分Dre和Cre时，各自特异性介导各自识别位点间的序列重组。
诱导拆分 dre 重组系统

[发明专利]一种蛋白质类泛素化修饰位点鉴定方法-CN201210398526.0有效
发明人：王立顺;汪彤丹;余韵;韩冰 -专利权人：上海交通大学医学院附属瑞金医院
申请日： 2012-10-18 - 公布日： 2014-05-07 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明涉及一种蛋白质类泛素化修饰位点鉴定方法，该特异性富集标记鉴定方法首先是对纯化后的类泛素化修饰蛋白质进行酶解，通过特异性类泛素化抗体富集类泛素化修饰的酶切肽段，随后利用化学标记对所富集肽段中的非修饰化的赖氨酸氨基残基进行保护，并经去泛素化酶催化反应以裸露出底物肽段序列上被修饰的赖氨酸，经液相色谱串联质谱联用仪分析肽段序列，通过蛋白质质谱数据分析软件匹配得到被化学修饰的肽段序列，其序列中含有游离氨基的赖氨酸位点即为类泛素化修饰位点与目前常用的基因突变方法获得位点方式比较，本发明的优点是无需繁琐的基因突变技术手段即可快速、高效、准确地得到蛋白质类泛素化修饰位点信息。
一种蛋白质类泛素化修饰鉴定方法

[发明专利]一种电喷雾质谱中多磷酸化位点肽段的检测和鉴定方法-CN200610134982.9无效
发明人：张丽华;王晖;段继诚;丛永正;张维冰;梁振;张玉奎 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2006-12-22 - 公布日： 2008-06-25 - 主分类号： G01N30/02 文献下载
摘要：本发明涉及磷酸化肽的检测方法，具体地说是一种电喷雾质谱中多磷酸化位点肽段的检测和鉴定方法。利用磷酸酶对磷酸化肽进行处理，通过控制磷酸化肽的去磷酸化程度，将处理后的样品与未处理的样品分别进入电喷雾质谱中进行分析和比较。从而测定磷酸化肽段，并确定其磷酸化位点。本发明的优点为：可作为一种电喷雾质谱中初步判断多磷酸化肽段存在的方法；可提高多磷酸化肽段的质谱响应信号和检出率；通过控制反应条件能够推测多磷酸化肽段的磷酸化位点，并可作为一种多级质谱分析的验证方法；方法简单
一种喷雾质谱中多磷酸化位点肽段检测鉴定方法

[发明专利]A型肉毒素突变体及其基因工程菌的构建-CN202211112222.3有效
发明人：沈玉保;包国庆;郭力鸣 -专利权人：君合盟生物制药（杭州）有限公司
申请日： 2022-09-13 - 公布日： 2023-09-29 - 主分类号： C07K14/33 文献下载
摘要：A型肉毒素突变体包括：第一肽段和第二肽段，所述第一肽段和所述第二肽段通过链间二硫键相连；其中，所述第一肽段相较于野生型A型肉毒素的轻链，具有第134位和/或第165位的突变；和/或所述第二肽段相较于野生型A型肉毒素的重链，具有如下突变位点的至少之一：第791位、第967位和第1060位。
肉毒素突变体及其基因工程构建

[发明专利]一种基于荧光聚合物量子点和氧化石墨烯检测MMP-9的方法-CN201910947759.3在审
发明人：吴芳玲;李巧玉;余绍宁 -专利权人：宁波大学
申请日： 2019-10-08 - 公布日： 2020-01-17 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于荧光聚合物量子点和氧化石墨烯检测MMP‑9的方法。本发明将氧化石墨烯‑肽段‑聚合物量子点纳米复合物与含有MMP‑9的溶液共同孵育后，采用荧光光度法分析测得MMP‑9的浓度；其中：氧化石墨烯‑肽段‑聚合物量子点纳米复合物通过聚合物量子点与含有特定MMP‑9切割位点的肽段连接后，再通过静电吸附与氧化石墨烯结合构建而得；所述含有特定MMP‑9切割位点的肽段的氨基酸序列为CCYGPLGLAGRRRKKK。
氧化石墨烯量子点肽段聚合物纳米复合物切割位点检测检测灵敏度荧光光度法荧光聚合物氨基酸序检测试剂静电吸附孵育构建制备分析

[发明专利]基于去SUMO化酶和SAX的SUMO化肽段富集方法-CN201911212642.7有效
发明人：张丽华;李洋;单亦初;杨开广;梁振;张玉奎 -专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
申请日： 2019-12-02 - 公布日： 2022-08-09 - 主分类号： C12P21/06 文献下载
摘要：本发明涉及一种基于去SUMO化酶和阴离子交换色谱的SUMO化修饰肽段的富集方法，首先将蛋白质样品的碱性位点酶解成多肽，在肽段水平封闭肽段的N末端和侧链的自由氨基，然后采用阴离子交换色谱预富集多肽中保留较强的SUMO化肽段，再对收集到的SUMO化肽段用去SUMO化酶进行去SUMO化，发生去SUMO化后的肽段在阴离子交换色谱中的保留将变弱，将样品再一次经过阴离子交换色谱，收集不保留的流份，通过将去SUMO化修饰的底物肽段与其他干扰肽段分离，实现对SUMO化修饰肽段的二次富集。本发明的优点是选择性高、富集效率高、可同时富集多类型的SUMO化修饰肽段、提高了SUMO化修饰位点的鉴定覆盖度。
基于 sumo sax 化肽段富集方法

[发明专利]一种用于监测磷酸化蛋白质组学中磷酸化肽段富集过程的方法-CN202310585540.X在审
发明人：张宝;陈亮宇;李捷 -专利权人：谱天（天津）生物科技有限公司
申请日： 2023-05-23 - 公布日： 2023-08-29 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于监测磷酸化蛋白质组学中磷酸化肽段富集过程的方法，包括以下步骤：1)设置至少两组外源肽段参考品，每组外源肽段参考品至少包含三条含有不同磷酸化修饰位点的肽段，并且对于每一组中每种肽段，在其他各组中均有序列一致，但是同位素标记不同的对应肽段；2)在样品处理过程中，在不同的时间点加入上述不同的外源肽段参考品，且任意两组外源肽段参考品加入的时间点之间，均包括磷酸化肽段富集的步骤；3)进样检测，提取处理数据，定量外源肽段参考品，计算不同磷酸化修饰肽段的得率比值，以此评价两个外源肽段参考品加入时间点之间的磷酸化富集过程是否合格。该方法能有效评价磷酸化肽段富集效率。
一种用于监测磷酸化蛋白质组学中富集过程方法

[发明专利]一种用于监测甲基化蛋白质组学中甲基化肽段富集过程的方法-CN202310756177.3在审
发明人：乔舰;张宝;陈亮宇;李捷 -专利权人：谱天（天津）生物科技有限公司
申请日： 2023-06-26 - 公布日： 2023-10-03 - 主分类号： G01N27/62 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于监测甲基化蛋白质组学中甲基化肽段富集过程的方法，包括以下步骤：1)设置至少两组外源肽段参考品，每组外源肽段参考品至少包含有三种不同甲基化修饰位点的肽段，并且对于每一组中每种肽段，在其他各组中均有序列一致，但是同位素标记不同的对应肽段；2)在样品处理过程中，在不同的时间点加入上述不同的外源肽段参考品，且任意两组外源肽段参考品加入的时间点之间，均包括甲基化肽段富集的步骤；3)进样检测，提取处理数据，定量外源肽段参考品，计算不同甲基化修饰肽段的得率比值，以此评价两个外源肽段参考品加入时间点之间的甲基化富集过程是否合格。该方法能有效评价甲基化肽段富集效率。
一种用于监测甲基化蛋白质组学中富集过程方法

[发明专利]一种用于监测泛素化蛋白质组学中泛素化肽段富集过程的方法-CN202310852603.3在审
发明人：乔舰;张宝;陈亮宇;李捷 -专利权人：谱天（天津）生物科技有限公司
申请日： 2023-07-12 - 公布日： 2023-10-20 - 主分类号： G01N33/68 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于监测泛素化蛋白质组学中泛素化肽段富集过程的方法，包括以下步骤：1)设置至少两组外源肽段参考品，每组外源肽段参考品至少包含一条有泛素化修饰位点的肽段，并且对于每一组中每种肽段，在其他各组中均有序列一致，但是同位素标记不同的对应肽段；2)在样品处理过程中，在不同的时间点加入上述不同的外源肽段参考品，且任意两组外源肽段参考品加入的时间点之间，均包括泛素化肽段富集的步骤；3)进样检测，提取处理数据，定量外源肽段参考品，计算不同泛素化修饰肽段的得率比值，以此评价两个外源肽段参考品加入时间点之间的泛素化富集过程是否合格。该方法能有效评价泛素化肽段富集效率。
一种用于监测泛素化蛋白质组学中泛素化肽段富集过程方法

[发明专利]一种胰岛素及其类似物O-糖基化位点的鉴定方法-CN201910727274.3有效
发明人：龚庆伟;冯艳;蒋燕;封启媛;徐军;谢灿;高相雷;李晓平;陈小锋;李文佳 -专利权人：东莞市东阳光生物药研发有限公司;广东东阳光药业有限公司
申请日： 2019-08-07 - 公布日： 2023-05-09 - 主分类号： G01N33/74 文献下载
摘要：本发明涉及生物化学领域，具体涉及一种胰岛素及其类似物O‑糖基化位点的鉴定方法。首先对胰岛素及其类似物进行弹性蛋白酶酶切，通过LC‑MS分析肽图谱，初步确定相应的糖基化肽段；然后对糖基化关键肽段进行Q‑TOF‑MS/MS分析，通过优化关键肽段的CID质谱碎裂能量，得到关键的带糖的碎片离子，从而更准确和简便的分析O糖基化位点。本发明在常规CID碎裂技术下即可实现复杂肽段的糖基化位点分析和确认，操作简单，准确度高，实用性强，经济，适用于所有带有CID碎裂技术的质谱仪，为糖基化类的翻译后修饰分析以及在蛋白质组学中的应用提供了一种新的思路
一种胰岛素及其类似物糖基化位点鉴定方法

[发明专利]一种对分裂位点进行筛选的方法及其应用-CN202210331773.2在审
发明人：王昊;杨丽丽 -专利权人：深圳先进技术研究院
申请日： 2022-03-31 - 公布日： 2022-06-21 - 主分类号： G16B35/20 文献下载
摘要：本发明提供一种对分裂位点进行筛选的方法及其应用。所述方法包括步骤：S1、数据库建立：使用计算机语言编写程序，预测内含肽在氨基酸序列中的每相邻的两个氨基酸残基中嵌入后都发生了剪接反应将自身切除，相邻肽段相连后形成的氨基酸序列组成蛋白数据库；S2、实验进行：在基因片段中插入内含肽序列片段后进行分子克隆，翻译后得到肽段，将该肽段通过质谱检测是否含有标记氨基酸序列，并与所述蛋白数据库进行比对，实现对断裂位点的证实。本发明的方法先通过计算机编程构建蛋白数据库，再进行实验并通过质谱实现分裂位点的检测和证实；通过质谱实现最终的检测，代替高通量筛选，将其拓展到可以将任意活性蛋白进行分裂位点的寻找。
一种分裂进行筛选方法及其应用

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